Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PF4V1P10720 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PF4V1P10720 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms