Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0DMU3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0DMU3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0DMU3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P0DMU3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0DMU3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0DMU3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0DMU3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P0DMU3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P0DMU3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
P0DMU3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P0DMU3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P0DMU3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P0DMU3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P0DMU3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0DMU3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0DMU3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0DMU3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0DMU3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0DMU3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0DMU3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0DMU3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0DMU3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0DMU3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P0DMU3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0DMU3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0DMU3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0DMU3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0DMU3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0DMU3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P0DMU3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P0DMU3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P0DMU3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P0DMU3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P0DMU3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P0DMU3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P0DMU3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P0DMU3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P0DMU3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P0DMU3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P0DMU3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P0DMU3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms