Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRGAP2BP0DMP2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRGAP2BP0DMP2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms