Protein–RNA interactions for Protein: P08603

CFH, Complement factor H, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHP08603 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHP08603 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHP08603 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHP08603 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHP08603 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHP08603 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHP08603 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHP08603 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHP08603 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHP08603 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHP08603 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHP08603 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHP08603 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHP08603 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHP08603 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFHP08603 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFHP08603 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHP08603 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHP08603 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHP08603 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHP08603 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHP08603 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHP08603 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHP08603 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHP08603 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHP08603 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHP08603 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHP08603 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHP08603 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFHP08603 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFHP08603 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFHP08603 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFHP08603 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHP08603 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHP08603 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHP08603 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHP08603 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFHP08603 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHP08603 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHP08603 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHP08603 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHP08603 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHP08603 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHP08603 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHP08603 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHP08603 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHP08603 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHP08603 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHP08603 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFHP08603 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFHP08603 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFHP08603 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFHP08603 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFHP08603 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFHP08603 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFHP08603 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFHP08603 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFHP08603 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms