Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI1P08151 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI1P08151 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI1P08151 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI1P08151 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI1P08151 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI1P08151 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI1P08151 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI1P08151 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI1P08151 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI1P08151 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI1P08151 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI1P08151 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GLI1P08151 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI1P08151 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI1P08151 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI1P08151 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI1P08151 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI1P08151 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI1P08151 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI1P08151 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI1P08151 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI1P08151 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GLI1P08151 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GLI1P08151 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI1P08151 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI1P08151 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI1P08151 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI1P08151 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI1P08151 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI1P08151 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI1P08151 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI1P08151 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI1P08151 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GLI1P08151 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GLI1P08151 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI1P08151 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI1P08151 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI1P08151 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI1P08151 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI1P08151 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI1P08151 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI1P08151 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI1P08151 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI1P08151 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI1P08151 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI1P08151 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI1P08151 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI1P08151 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GLI1P08151 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI1P08151 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI1P08151 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI1P08151 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI1P08151 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI1P08151 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI1P08151 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI1P08151 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GLI1P08151 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GLI1P08151 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms