Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NGFRP08138 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NGFRP08138 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NGFRP08138 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NGFRP08138 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NGFRP08138 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NGFRP08138 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NGFRP08138 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NGFRP08138 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NGFRP08138 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NGFRP08138 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NGFRP08138 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NGFRP08138 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NGFRP08138 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NGFRP08138 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NGFRP08138 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NGFRP08138 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NGFRP08138 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NGFRP08138 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NGFRP08138 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NGFRP08138 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NGFRP08138 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NGFRP08138 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NGFRP08138 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NGFRP08138 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NGFRP08138 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NGFRP08138 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NGFRP08138 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NGFRP08138 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NGFRP08138 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NGFRP08138 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NGFRP08138 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NGFRP08138 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NGFRP08138 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NGFRP08138 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NGFRP08138 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NGFRP08138 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NGFRP08138 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NGFRP08138 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NGFRP08138 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NGFRP08138 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NGFRP08138 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NGFRP08138 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NGFRP08138 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NGFRP08138 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NGFRP08138 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NGFRP08138 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NGFRP08138 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NGFRP08138 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NGFRP08138 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms