Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLBP06746 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLBP06746 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLBP06746 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLBP06746 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLBP06746 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLBP06746 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLBP06746 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLBP06746 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLBP06746 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLBP06746 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLBP06746 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLBP06746 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLBP06746 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLBP06746 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLBP06746 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLBP06746 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLBP06746 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLBP06746 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLBP06746 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLBP06746 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLBP06746 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLBP06746 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLBP06746 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLBP06746 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLBP06746 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLBP06746 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLBP06746 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLBP06746 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLBP06746 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLBP06746 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLBP06746 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLBP06746 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLBP06746 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLBP06746 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLBP06746 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLBP06746 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLBP06746 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLBP06746 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLBP06746 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLBP06746 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLBP06746 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLBP06746 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLBP06746 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLBP06746 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLBP06746 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLBP06746 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLBP06746 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLBP06746 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLBP06746 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLBP06746 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLBP06746 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLBP06746 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLBP06746 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLBP06746 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLBP06746 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLBP06746 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLBP06746 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLBP06746 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLBP06746 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLBP06746 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLBP06746 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLBP06746 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLBP06746 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLBP06746 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLBP06746 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLBP06746 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLBP06746 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLBP06746 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLBP06746 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms