Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APODP05090 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APODP05090 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APODP05090 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APODP05090 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APODP05090 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APODP05090 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APODP05090 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APODP05090 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APODP05090 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APODP05090 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APODP05090 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APODP05090 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APODP05090 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APODP05090 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APODP05090 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APODP05090 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APODP05090 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APODP05090 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APODP05090 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APODP05090 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APODP05090 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APODP05090 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APODP05090 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APODP05090 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APODP05090 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APODP05090 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APODP05090 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APODP05090 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APODP05090 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APODP05090 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APODP05090 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APODP05090 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APODP05090 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APODP05090 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APODP05090 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APODP05090 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APODP05090 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APODP05090 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
APODP05090 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APODP05090 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APODP05090 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APODP05090 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APODP05090 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APODP05090 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APODP05090 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APODP05090 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APODP05090 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APODP05090 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APODP05090 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APODP05090 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APODP05090 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APODP05090 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APODP05090 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APODP05090 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APODP05090 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APODP05090 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APODP05090 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APODP05090 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APODP05090 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APODP05090 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APODP05090 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APODP05090 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APODP05090 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APODP05090 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APODP05090 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APODP05090 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APODP05090 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APODP05090 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APODP05090 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APODP05090 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APODP05090 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APODP05090 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APODP05090 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APODP05090 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APODP05090 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APODP05090 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
APODP05090 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APODP05090 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APODP05090 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APODP05090 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APODP05090 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APODP05090 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APODP05090 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APODP05090 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APODP05090 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APODP05090 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APODP05090 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APODP05090 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APODP05090 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APODP05090 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APODP05090 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APODP05090 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APODP05090 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APODP05090 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APODP05090 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APODP05090 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APODP05090 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APODP05090 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APODP05090 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms