Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FGAP02671 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGAP02671 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGAP02671 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGAP02671 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGAP02671 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGAP02671 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGAP02671 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGAP02671 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FGAP02671 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGAP02671 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGAP02671 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGAP02671 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGAP02671 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGAP02671 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGAP02671 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGAP02671 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FGAP02671 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
FGAP02671 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FGAP02671 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
FGAP02671 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGAP02671 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGAP02671 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGAP02671 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FGAP02671 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FGAP02671 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGAP02671 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGAP02671 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGAP02671 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGAP02671 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGAP02671 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGAP02671 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGAP02671 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGAP02671 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGAP02671 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGAP02671 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGAP02671 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGAP02671 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGAP02671 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGAP02671 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FGAP02671 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGAP02671 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGAP02671 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGAP02671 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGAP02671 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGAP02671 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FGAP02671 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGAP02671 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGAP02671 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGAP02671 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGAP02671 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGAP02671 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGAP02671 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGAP02671 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FGAP02671 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGAP02671 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGAP02671 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGAP02671 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGAP02671 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGAP02671 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGAP02671 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FGAP02671 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGAP02671 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGAP02671 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGAP02671 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FGAP02671 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGAP02671 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FGAP02671 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGAP02671 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGAP02671 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGAP02671 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FGAP02671 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGAP02671 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FGAP02671 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGAP02671 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGAP02671 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGAP02671 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGAP02671 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGAP02671 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGAP02671 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FGAP02671 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FGAP02671 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGAP02671 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGAP02671 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGAP02671 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGAP02671 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGAP02671 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGAP02671 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGAP02671 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGAP02671 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGAP02671 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGAP02671 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGAP02671 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FGAP02671 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGAP02671 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGAP02671 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FGAP02671 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FGAP02671 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGAP02671 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FGAP02671 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms