Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC3P02656 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC3P02656 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC3P02656 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC3P02656 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC3P02656 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC3P02656 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC3P02656 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC3P02656 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC3P02656 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC3P02656 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC3P02656 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOC3P02656 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOC3P02656 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOC3P02656 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC3P02656 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC3P02656 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC3P02656 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC3P02656 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC3P02656 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC3P02656 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC3P02656 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC3P02656 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC3P02656 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC3P02656 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC3P02656 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC3P02656 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC3P02656 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC3P02656 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOC3P02656 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC3P02656 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC3P02656 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC3P02656 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC3P02656 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC3P02656 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC3P02656 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC3P02656 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC3P02656 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC3P02656 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC3P02656 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC3P02656 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC3P02656 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC3P02656 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOC3P02656 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC3P02656 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC3P02656 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC3P02656 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOC3P02656 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC3P02656 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC3P02656 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
APOC3P02656 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC3P02656 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC3P02656 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC3P02656 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC3P02656 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC3P02656 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC3P02656 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC3P02656 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC3P02656 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC3P02656 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC3P02656 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC3P02656 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC3P02656 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOC3P02656 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms