Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
F13A1P00488 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
F13A1P00488 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
F13A1P00488 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
F13A1P00488 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
F13A1P00488 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
F13A1P00488 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
F13A1P00488 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
F13A1P00488 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
F13A1P00488 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
F13A1P00488 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
F13A1P00488 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
F13A1P00488 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
F13A1P00488 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
F13A1P00488 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
F13A1P00488 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
F13A1P00488 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
F13A1P00488 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
F13A1P00488 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
F13A1P00488 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
F13A1P00488 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
F13A1P00488 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
F13A1P00488 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
F13A1P00488 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
F13A1P00488 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
F13A1P00488 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
F13A1P00488 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
F13A1P00488 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
F13A1P00488 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
F13A1P00488 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
F13A1P00488 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
F13A1P00488 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
F13A1P00488 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
F13A1P00488 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
F13A1P00488 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
F13A1P00488 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
F13A1P00488 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
F13A1P00488 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
F13A1P00488 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
F13A1P00488 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
F13A1P00488 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
F13A1P00488 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
F13A1P00488 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
F13A1P00488 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
F13A1P00488 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
F13A1P00488 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
F13A1P00488 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
F13A1P00488 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
F13A1P00488 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
F13A1P00488 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
F13A1P00488 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
F13A1P00488 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
F13A1P00488 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
F13A1P00488 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
F13A1P00488 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
F13A1P00488 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F13A1P00488 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F13A1P00488 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
F13A1P00488 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F13A1P00488 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
F13A1P00488 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F13A1P00488 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F13A1P00488 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
F13A1P00488 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
F13A1P00488 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
F13A1P00488 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F13A1P00488 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F13A1P00488 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F13A1P00488 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F13A1P00488 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F13A1P00488 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F13A1P00488 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
F13A1P00488 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F13A1P00488 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F13A1P00488 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
F13A1P00488 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F13A1P00488 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
F13A1P00488 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F13A1P00488 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F13A1P00488 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
F13A1P00488 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
F13A1P00488 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
F13A1P00488 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
F13A1P00488 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
F13A1P00488 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
F13A1P00488 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
F13A1P00488 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F13A1P00488 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F13A1P00488 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F13A1P00488 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F13A1P00488 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F13A1P00488 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
F13A1P00488 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F13A1P00488 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F13A1P00488 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F13A1P00488 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F13A1P00488 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F13A1P00488 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F13A1P00488 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F13A1P00488 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms