Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPP00450 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPP00450 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPP00450 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPP00450 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPP00450 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPP00450 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPP00450 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPP00450 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPP00450 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPP00450 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPP00450 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPP00450 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPP00450 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPP00450 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPP00450 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPP00450 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPP00450 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPP00450 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPP00450 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPP00450 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPP00450 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPP00450 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPP00450 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPP00450 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPP00450 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPP00450 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPP00450 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPP00450 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPP00450 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPP00450 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPP00450 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPP00450 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPP00450 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPP00450 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPP00450 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPP00450 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPP00450 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPP00450 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPP00450 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPP00450 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPP00450 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPP00450 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPP00450 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPP00450 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPP00450 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms