Protein–RNA interactions for Protein: O95967

EFEMP2, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP2O95967 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP2O95967 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EFEMP2O95967 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms