Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACSL3O95573 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACSL3O95573 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms