Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOO75962 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOO75962 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOO75962 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOO75962 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOO75962 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOO75962 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIOO75962 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIOO75962 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOO75962 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOO75962 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOO75962 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOO75962 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOO75962 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOO75962 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOO75962 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOO75962 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOO75962 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOO75962 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOO75962 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOO75962 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOO75962 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOO75962 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOO75962 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOO75962 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOO75962 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOO75962 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOO75962 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOO75962 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOO75962 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOO75962 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOO75962 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOO75962 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOO75962 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOO75962 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOO75962 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOO75962 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOO75962 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOO75962 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOO75962 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOO75962 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOO75962 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOO75962 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOO75962 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOO75962 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOO75962 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOO75962 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOO75962 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOO75962 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOO75962 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOO75962 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOO75962 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOO75962 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOO75962 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOO75962 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOO75962 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOO75962 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOO75962 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOO75962 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOO75962 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOO75962 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIOO75962 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOO75962 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOO75962 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOO75962 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms