Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PPFIA4O75335 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPFIA4O75335 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms