Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP12O75317 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP12O75317 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP12O75317 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP12O75317 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP12O75317 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP12O75317 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP12O75317 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP12O75317 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP12O75317 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP12O75317 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP12O75317 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP12O75317 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP12O75317 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP12O75317 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP12O75317 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP12O75317 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP12O75317 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP12O75317 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP12O75317 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP12O75317 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP12O75317 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP12O75317 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP12O75317 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP12O75317 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP12O75317 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP12O75317 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP12O75317 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP12O75317 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP12O75317 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP12O75317 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP12O75317 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP12O75317 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP12O75317 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP12O75317 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP12O75317 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP12O75317 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP12O75317 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP12O75317 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP12O75317 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP12O75317 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP12O75317 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP12O75317 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP12O75317 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP12O75317 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP12O75317 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP12O75317 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP12O75317 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP12O75317 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP12O75317 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP12O75317 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP12O75317 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP12O75317 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP12O75317 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP12O75317 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP12O75317 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP12O75317 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP12O75317 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP12O75317 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP12O75317 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP12O75317 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP12O75317 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP12O75317 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.6 ms