Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIN3BO75182 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIN3BO75182 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms