Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG13O75143 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG13O75143 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG13O75143 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG13O75143 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG13O75143 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG13O75143 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG13O75143 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG13O75143 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG13O75143 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG13O75143 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG13O75143 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG13O75143 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG13O75143 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG13O75143 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG13O75143 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG13O75143 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG13O75143 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG13O75143 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG13O75143 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG13O75143 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG13O75143 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG13O75143 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG13O75143 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG13O75143 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG13O75143 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG13O75143 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG13O75143 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG13O75143 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG13O75143 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG13O75143 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG13O75143 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG13O75143 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG13O75143 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG13O75143 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG13O75143 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG13O75143 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG13O75143 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG13O75143 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG13O75143 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG13O75143 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG13O75143 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATG13O75143 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG13O75143 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG13O75143 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG13O75143 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG13O75143 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG13O75143 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG13O75143 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG13O75143 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG13O75143 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG13O75143 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG13O75143 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG13O75143 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATG13O75143 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG13O75143 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG13O75143 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG13O75143 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG13O75143 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG13O75143 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG13O75143 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG13O75143 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATG13O75143 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG13O75143 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms