Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUPR1O60356 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUPR1O60356 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms