Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK2O60296 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK2O60296 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms