Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE6DO43924 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms