Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAD51CO43502 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD51CO43502 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51CO43502 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms