Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RASA4O43374 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASA4O43374 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASA4O43374 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASA4O43374 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASA4O43374 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASA4O43374 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASA4O43374 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASA4O43374 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASA4O43374 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASA4O43374 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASA4O43374 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASA4O43374 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASA4O43374 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASA4O43374 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RASA4O43374 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASA4O43374 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASA4O43374 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RASA4O43374 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RASA4O43374 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RASA4O43374 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASA4O43374 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASA4O43374 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASA4O43374 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RASA4O43374 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASA4O43374 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASA4O43374 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASA4O43374 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASA4O43374 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASA4O43374 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASA4O43374 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASA4O43374 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASA4O43374 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASA4O43374 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASA4O43374 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASA4O43374 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASA4O43374 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASA4O43374 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASA4O43374 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASA4O43374 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASA4O43374 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASA4O43374 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASA4O43374 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASA4O43374 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RASA4O43374 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASA4O43374 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASA4O43374 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RASA4O43374 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASA4O43374 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASA4O43374 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASA4O43374 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASA4O43374 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RASA4O43374 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASA4O43374 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASA4O43374 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASA4O43374 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASA4O43374 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASA4O43374 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASA4O43374 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms