Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTSS1O43312 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTSS1O43312 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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