Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRTM2O43300 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LRRTM2O43300 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
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