Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF1O43189 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHF1O43189 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHF1O43189 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF1O43189 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF1O43189 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF1O43189 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF1O43189 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF1O43189 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF1O43189 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF1O43189 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF1O43189 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF1O43189 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHF1O43189 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHF1O43189 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF1O43189 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF1O43189 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF1O43189 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF1O43189 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF1O43189 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF1O43189 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF1O43189 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF1O43189 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF1O43189 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF1O43189 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF1O43189 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF1O43189 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF1O43189 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF1O43189 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF1O43189 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF1O43189 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF1O43189 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF1O43189 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF1O43189 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF1O43189 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF1O43189 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF1O43189 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF1O43189 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF1O43189 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF1O43189 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF1O43189 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF1O43189 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF1O43189 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF1O43189 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF1O43189 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms