Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLOCKO15516 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CLOCKO15516 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms