Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM38O00635 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM38O00635 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM38O00635 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM38O00635 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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