Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXLO00592 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXLO00592 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXLO00592 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXLO00592 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXLO00592 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXLO00592 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXLO00592 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXLO00592 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXLO00592 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXLO00592 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXLO00592 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PODXLO00592 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXLO00592 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXLO00592 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXLO00592 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXLO00592 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXLO00592 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXLO00592 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXLO00592 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXLO00592 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXLO00592 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXLO00592 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXLO00592 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PODXLO00592 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXLO00592 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXLO00592 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXLO00592 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXLO00592 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXLO00592 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXLO00592 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXLO00592 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXLO00592 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXLO00592 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXLO00592 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXLO00592 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PODXLO00592 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXLO00592 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXLO00592 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXLO00592 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXLO00592 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXLO00592 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXLO00592 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXLO00592 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXLO00592 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXLO00592 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXLO00592 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXLO00592 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXLO00592 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXLO00592 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXLO00592 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PODXLO00592 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXLO00592 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXLO00592 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXLO00592 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXLO00592 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXLO00592 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXLO00592 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXLO00592 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXLO00592 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXLO00592 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXLO00592 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXLO00592 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXLO00592 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXLO00592 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PODXLO00592 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXLO00592 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXLO00592 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXLO00592 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXLO00592 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXLO00592 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXLO00592 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXLO00592 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXLO00592 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXLO00592 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PODXLO00592 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXLO00592 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXLO00592 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXLO00592 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXLO00592 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXLO00592 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXLO00592 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXLO00592 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXLO00592 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXLO00592 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXLO00592 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXLO00592 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXLO00592 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXLO00592 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXLO00592 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PODXLO00592 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PODXLO00592 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PODXLO00592 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PODXLO00592 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PODXLO00592 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PODXLO00592 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PODXLO00592 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PODXLO00592 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PODXLO00592 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PODXLO00592 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms