Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GOLIM4O00461 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLIM4O00461 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms