Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
I3L4J1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
I3L4J1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
I3L4J1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
I3L4J1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
I3L4J1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
I3L4J1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
I3L4J1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
I3L4J1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
I3L4J1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
I3L4J1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
I3L4J1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
I3L4J1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
I3L4J1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
I3L4J1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
I3L4J1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
I3L4J1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
I3L4J1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
I3L4J1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
I3L4J1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
I3L4J1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
I3L4J1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
I3L4J1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
I3L4J1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
I3L4J1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
I3L4J1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
I3L4J1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
I3L4J1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
I3L4J1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
I3L4J1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
I3L4J1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
I3L4J1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
I3L4J1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
I3L4J1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
I3L4J1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
I3L4J1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
I3L4J1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
I3L4J1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
I3L4J1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
I3L4J1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
I3L4J1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
I3L4J1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
I3L4J1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
I3L4J1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
I3L4J1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
I3L4J1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
I3L4J1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
I3L4J1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
I3L4J1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
I3L4J1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
I3L4J1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
I3L4J1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
I3L4J1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
I3L4J1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
I3L4J1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
I3L4J1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
I3L4J1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
I3L4J1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
I3L4J1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
I3L4J1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
I3L4J1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
I3L4J1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms