Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQF6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQF6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQF6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQF6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQF6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQF6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQF6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQF6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQF6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQF6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQF6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQF6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQF6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BQF6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQF6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQF6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQF6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQF6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQF6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQF6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQF6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQF6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BQF6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BQF6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQF6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQF6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQF6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQF6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQF6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQF6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQF6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQF6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQF6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BQF6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BQF6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BQF6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BQF6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BQF6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BQF6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BQF6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BQF6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BQF6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BQF6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BQF6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BQF6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BQF6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BQF6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H3BQF6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BQF6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BQF6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BQF6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BQF6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BQF6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BQF6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BQF6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BQF6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQF6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQF6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQF6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQF6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQF6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BQF6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms