Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E5RI56 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E5RI56 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E5RI56 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E5RI56 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E5RI56 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
E5RI56 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E5RI56 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E5RI56 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E5RI56 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E5RI56 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E5RI56 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E5RI56 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E5RI56 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E5RI56 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E5RI56 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E5RI56 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E5RI56 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E5RI56 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E5RI56 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E5RI56 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E5RI56 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E5RI56 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E5RI56 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E5RI56 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
E5RI56 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E5RI56 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E5RI56 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E5RI56 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E5RI56 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E5RI56 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E5RI56 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E5RI56 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E5RI56 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E5RI56 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E5RI56 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E5RI56 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E5RI56 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E5RI56 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E5RI56 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E5RI56 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E5RI56 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E5RI56 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E5RI56 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
E5RI56 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E5RI56 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E5RI56 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E5RI56 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E5RI56 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
E5RI56 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E5RI56 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E5RI56 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
E5RI56 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E5RI56 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E5RI56 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E5RI56 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E5RI56 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E5RI56 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E5RI56 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E5RI56 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E5RI56 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E5RI56 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E5RI56 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E5RI56 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E5RI56 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E5RI56 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E5RI56 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E5RI56 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E5RI56 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E5RI56 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E5RI56 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
E5RI56 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E5RI56 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E5RI56 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E5RI56 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E5RI56 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E5RI56 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E5RI56 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E5RI56 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E5RI56 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E5RI56 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E5RI56 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E5RI56 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E5RI56 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E5RI56 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E5RI56 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E5RI56 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E5RI56 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E5RI56 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E5RI56 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E5RI56 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E5RI56 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E5RI56 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E5RI56 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E5RI56 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E5RI56 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E5RI56 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E5RI56 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E5RI56 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E5RI56 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms