Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VGLL3A8MV65 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VGLL3A8MV65 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms