Protein–RNA interactions for Protein: A8MUA0

Putative UPF0607 protein ENSP00000381514, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUA0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MUA0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MUA0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MUA0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MUA0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A8MUA0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MUA0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MUA0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MUA0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MUA0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MUA0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MUA0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MUA0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MUA0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A8MUA0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
A8MUA0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
A8MUA0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MUA0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MUA0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MUA0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MUA0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MUA0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MUA0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MUA0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MUA0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MUA0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MUA0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MUA0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MUA0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MUA0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A8MUA0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A8MUA0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MUA0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MUA0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MUA0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MUA0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MUA0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MUA0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MUA0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MUA0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
A8MUA0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
A8MUA0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
A8MUA0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A8MUA0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A8MUA0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
A8MUA0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
A8MUA0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms