Protein–RNA interactions for Protein: A8K8P3

SFI1, Protein SFI1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFI1A8K8P3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFI1A8K8P3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SFI1A8K8P3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFI1A8K8P3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms