Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC169A6NNP5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC169A6NNP5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC169A6NNP5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms