Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDYE4A6NLX3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYE4A6NLX3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms