Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCNX2A6NKB5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCNX2A6NKB5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms