Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HELTA6NFD8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HELTA6NFD8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms