Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTAGE9A4FU28 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTAGE9A4FU28 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms