Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
VWA8A3KMH1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VWA8A3KMH1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VWA8A3KMH1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms