Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC162PA2VCL2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms