Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9orf170A2RU37 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf170A2RU37 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms