Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0U1RQJ8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0U1RQJ8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms