Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 GOLGA2P1-201ENST00000512938 2906 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CEP89-207ENST00000591863 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 RIMKLA-202ENST00000431473 8909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 LRG1-201ENST00000306390 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PAX6-245ENST00000638914 7300 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TIAM2-212ENST00000529824 5262 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 OARD1-214ENST00000486443 764 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PRKAR1A-217ENST00000589228 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CHI3L2-201ENST00000369744 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PRKACB-206ENST00000370689 4513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 KBTBD6-201ENST00000379485 5178 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC008663.2-201ENST00000517299 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 FUT10-211ENST00000524021 2042 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 APOL3-201ENST00000349314 2117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TLE3-213ENST00000558379 2304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CIZ1-228ENST00000634901 3462 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 OR10H5-202ENST00000642092 7044 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 RGL1-201ENST00000304685 5100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PCDHB11-201ENST00000354757 4198 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 POLR3H-203ENST00000396504 4176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 GBE1-201ENST00000429644 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SYS1-201ENST00000243918 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 LINC01070-201ENST00000561786 2829 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC037459.3-201ENST00000521025 2750 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC138761.4-202ENST00000577956 2552 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 DRC1-201ENST00000288710 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PPP2R1B-202ENST00000341980 1953 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 HSPA8P7-201ENST00000443628 1948 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 NF2-207ENST00000397789 1857 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 KRT40-202ENST00000398486 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 FAM170A-206ENST00000613773 1374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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