Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 RAI2-202ENST00000360011 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC092159.2-201ENST00000445418 1943 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AF131215.4-201ENST00000526648 1741 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC100774.1-201ENST00000565581 1603 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SPATS2L-208ENST00000409718 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 TTC17-202ENST00000299240 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 KIAA0319L-202ENST00000373266 2377 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AL365194.1-201ENST00000440032 361 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 CHIAP2-202ENST00000449687 669 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 TMEM107-205ENST00000449985 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 IGHV3-6-201ENST00000518407 347 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC114321.1-201ENST00000520075 533 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 LMO3-228ENST00000541846 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 OSBPL9-207ENST00000462759 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC068234.1-201ENST00000560629 2785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ATP2C2-202ENST00000416219 3472 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC010148.1-203ENST00000413842 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 FAM153B-211ENST00000510151 1641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 FAM153A-216ENST00000510276 1641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 GOLGA2P1-201ENST00000512938 2906 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SEPT4-203ENST00000393086 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LMO3Q8TAP4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LMO3Q8TAP4 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LMO3Q8TAP4 LINC02105-201ENST00000504552 1003 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 IKBKE-202ENST00000579827 678 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 CEP83-201ENST00000339839 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 DNAJB8-202ENST00000469083 3365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 SMAD3-204ENST00000540846 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 PRKAG1-205ENST00000547306 1531 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LMO3Q8TAP4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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