Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CCT6P3-202ENST00000426828 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RNF217-210ENST00000521654 11325 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ZNF419-206ENST00000426954 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RBM7-203ENST00000540163 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ADAMTS20-204ENST00000553158 4633 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CLSTN3-201ENST00000266546 4185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KBTBD6-201ENST00000379485 5178 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CAMK2G-202ENST00000322635 3720 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RBM28-202ENST00000415472 2251 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 HIST1H2BE-202ENST00000634910 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ZNF488-201ENST00000585316 3496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SYT10-201ENST00000228567 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CDK20-204ENST00000375883 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ZNF565-202ENST00000355114 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FAM98A-202ENST00000403368 2818 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FUT2-202ENST00000425340 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PPP1R26P3-201ENST00000612861 3800 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TRERF1-203ENST00000372917 3914 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC105429.1-201ENST00000612833 4001 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PELO-201ENST00000274311 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SEPT3-202ENST00000396425 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CACNA2D4-219ENST00000585708 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 EGFLAM-202ENST00000336740 3071 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 EPB41L2-208ENST00000524581 3090 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TMEM18-202ENST00000355654 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 LBP-201ENST00000217407 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TGM5-202ENST00000349114 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC114811.2-201ENST00000569927 5647 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CUL9-201ENST00000252050 7780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SMG7-212ENST00000507469 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 KNSTRN-203ENST00000448395 1464 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PTCH2-201ENST00000372192 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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LSAMPQ13449 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 EIF3J-AS1-204ENST00000560049 639 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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LSAMPQ13449 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 DLAT-202ENST00000393051 3517 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 FAM13B-202ENST00000420893 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ZNF700-203ENST00000622593 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RIPOR1-205ENST00000540839 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SYNE1-237ENST00000539504 3768 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RHBDF2-215ENST00000591885 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 EXOC7-221ENST00000634349 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 VDAC1-202ENST00000395044 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 PBX1-212ENST00000540236 6175 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AP000533.2-201ENST00000417863 2260 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 AC048338.1-201ENST00000535844 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 SLC25A25-201ENST00000373064 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 IGBP1-201ENST00000342206 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 RBM3-201ENST00000354480 1884 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 WNK4-201ENST00000246914 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LSAMPQ13449 ENPP4-201ENST00000321037 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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