Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 NSA2-201ENST00000296802 1199 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 LINC01556-201ENST00000377186 466 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC002066.1-201ENST00000446355 514 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC099681.2-201ENST00000449899 543 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 NEURL1-AS1-202ENST00000453753 640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AL139807.1-201ENST00000500636 704 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ZNF970P-201ENST00000547456 223 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC105020.5-201ENST00000614810 423 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 NF2-204ENST00000361166 1837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 BEST3-201ENST00000266661 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 LBP-201ENST00000217407 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ZNF548-201ENST00000336128 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 GRHL3-202ENST00000350501 2119 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 SPATA13-205ENST00000409126 2111 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC037459.3-201ENST00000521025 2750 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 GOLGA8Q-201ENST00000562783 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 MRPL24-201ENST00000361531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 C22orf15-203ENST00000402217 829 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 NT5CP1-201ENST00000554092 509 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AP001150.1-201ENST00000558822 2128 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC005746.1-202ENST00000585495 716 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LMO3Q8TAP4 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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